不同細菌對于生長環境酸堿值的喜好程度亦不盡相同，大部分的微生物喜歡在中性(pH6.5~7.5)的環境下生長。根據細菌對于pH值的嗜好程度可分為：

 

嗜酸性菌

此類細菌適合生長于pH值低于6.0的環境，如乳酸桿菌可生長在pH4.0~5.0之間。

 

嗜中性菌

此類細菌適合生長于pH值在6.0~8.0之間的環境，如大部分人類及動物的致病菌屬之。

 

嗜堿性菌

此類細菌偏好生長在pH值高于8.0的環境，如常導致人類嚴重腸胃炎的霍亂弧菌(Vibrio cholerae)，其適生長的pH值介于8.5~9.5之間。

 

滲透壓

水分子通過細胞膜的特殊方式稱為滲透(osmosis)，影響細胞中水分子滲透的主要因素包括壓力(pressure)和溶質濃度(solute concentration)。由于細菌細胞膜與真核生物細胞膜皆為選擇性的半通透膜，當在菌體細胞中增加滲透壓力時就會升高水分子的位能，而降低滲透壓力時即可減少水分子的位能，因此細菌生存環境滲透壓的大小會直接影響菌體細胞水分子的進出。

當菌體處于高離子濃度（高張溶液）的環境下，菌體內的水分子會向細胞外流出，以致菌體會因脫水造成胞漿剝離(plasmolysis)現象而失去其生理活性，這就是醃漬食物（如蜜餞、醬菜等）不易腐壞而能長久保存的原因。

 

 

 

濕度

環境的濕度對微生物的生長非常重要，通常環境濕度過低時往往造成培養基過于乾燥而使菌體死亡，尤其是真菌（如黴菌）菌絲的生長更需要較高濕度的環境。太過乾燥并不利于微生物的生存，這也就是乾燥環境可使物質保存更久而不易腐敗的原因。

 

光線

除了少數光合成細菌(photosynthetic bacteria)如紫硫菌(thiorhodaceae)可利用光來進行光合作用外，絕大部分細菌的生長并不需要光線的存在，甚至日光中的紫外線對菌體的生長反而有害，易造成菌體細胞的DNA發生突變或導致菌體死亡。